一 饲料因素
饲料中的各种抗营养因子，如单宁酸、植酸、棉酚和抗胰蛋白酶等，易与肠壁黏膜结合，导致肠壁的损伤，饲料中电解质平衡失调，使排泄的粪便湿度增加，都使球虫病的发生率提高；饲料中维生素A和维生素K缺乏，使消化道黏膜和血液凝固机制受损，容易遭受球虫病的侵袭；限制饲养时，鸡由于饥饿，啄食垫料，感染的机会增加，也会提高发病率。优质全价饲料能提高机体对球虫病的抵抗能力，蛋白质、维生素、无机盐等饲料组分在控制球虫病上具有重要意义，饲喂粗砂粒、颗粒饲料及粗纤维饲料也会降低球虫发病率。
二 管理因素
1温、湿度
当冬季鸡舍温度低于20℃，或非常干燥时，因球虫卵囊孢子化不良，鸡球虫病的发生也随之减少；在高温和高湿的夏季，鸡球虫病的发病率较高，特别是在南方湿度大的梅雨季节前后为多发时期，此期，由于垫料较潮湿，球虫病会反复发作。
2卫生、防疫
加强卫生消毒、合理防疫。小型鸡场和养鸡专业户由于鸡场条件差，技术力量薄弱，对球虫病不够重视，容易暴发球虫病。
3 间断光照
间断光照比连续光照感染球虫的危险性要高些，原因是前者会造成鸡积极翻动垫料而致感染机会增加，翻动垫料也改善了卵囊孢子化条件。
4垫料
垫料的管理在控制球虫病上具有重要意义，垫料的管理不可忽视，其总的要求是：松、干、薄。
5 密度
高密度饲养是一种不良致病因素，当密度过大，鸡舍内空气较差，球虫病的发病率较高。高密度鸡群会造成卵囊密度增加，而致感染机会提高。
6饲养方式
饲养方式不同可引起对球虫病感染的显著差别，对网上饲养的鸡群而言，感染球虫病的机会是极低的。这主要是网上饲养的鸡不容易接近地面感染源的原因。
三 应激因素
球虫病常在应激反应出现的几天后发生。这些应激反应包括营养失调、习性的改变、运输和气候变化等。剧烈的应激反应除有利于球虫病的发病外，还可促进球虫病的恶化。鸡群如受到马立克氏病感染，机体对球虫免疫会受到干扰而引发球虫病；感染了法氏囊炎病毒的鸡会使球虫病的症状加剧，可致盲肠出血提前，死亡率提高，黄曲霉毒素的存在会使球虫病死亡率提高40％。
四 宿主差异
鸡的品种、年龄、性别不同，对球虫病抵抗力有显著差别。一般而言，幼雏对球虫的易感性较大；公雏对球虫的易感性高于母雏；白鸡的抵抗力比褐色鸡的抵抗力差；品系越纯对球虫的易感染性越强。
五 耐药性
由于抗球虫药的长期使用，以及使用方法不当，球虫很容易对一些药物产生耐药性。任何一种抗球虫药在使用一定时间后，都会引起球虫耐药性甚至形成耐药虫株，并对该药同类或作用机理相同的其他药物产生交叉耐药性，因而，选择合理的用药方法，制订正确的用药方案，可以最大限度地延长抗球虫药的使用寿命。
六 球虫虫株的种类、数量以及寄生部位
虫株不同，其致病力也不同，感染数量未达到一定程度，其个体不表现出球虫症状，对中等毒力的虫株而言，感染数量过多时，昕产生新的卵囊数却相应减少，称为“相挤效应”，不同虫株有其特定寄生部位，如果寄生部位发生改变，其致病力会下降乃至消失。
七 与其他病原关系
组织损伤和肠道功能的变化可造成各种有害细菌的入侵和繁殖，在鸡体内大肠杆菌和球虫之间有相互作用。研究表明球虫与其他肠道细菌具有协同作用，肠道细菌会起到增强球虫致病力的作用。