有些农民朋友认为，鸡粪腐熟了就不臭了，不臭就不肥沃了，因而不进行腐熟或者腐熟不够彻底，这是不对的。
未进行腐熟或腐熟不够的鸡粪，含有大量的病菌，容易引发作物根部病害。未腐熟的鸡粪施入土壤后，经土壤中微生物作用发酵腐熟，产生的有机酸和热量常危及作物根系的正常生长，造成烧根。而鸡粪中的臭味多是鸡粪中散发的氨气和甲烷等气体，挥发了不仅降低了肥效、污染了环境，也会造成熏苗。
鸡粪完全腐熟的主要标志为:无臭味，颜色变深褐色至黑色。判断腐熟程度时应视粪堆里层颜色变黑为准，不能以处理的时间长短来论处。
若因施用没腐熟或腐熟程度不够的鸡粪，出现了烧苗等现象，可采用如下措施补救。
冲施腐熟剂。如果鸡粪没腐熟好，蔬菜定植后2～3天就会出现烧苗症状，此时应及时冲施有机物腐熟剂，加快鸡粪腐熟。每亩每次冲施肥力高2公斤，能达到快速腐熟的目的。
加强通风。若对棚室蔬菜施用，因相对密闭，鸡粪在腐熟过程中产生的氨气挥发不出去，很容易熏坏蔬菜。因此，若发现烧苗现象，应增加放风次数和时间，以便把棚内的氨气及时排出棚外，从而避免气害的发生。
叶面喷洒植物生长调节剂。当蔬菜出现烧苗时，可用生根剂灌根，促进根系生长。也可用6000倍的爱多收和云大120叶面喷洒，能显著增强植株长势和抗逆抗病能力。